La historia comienza cuando Manta Oyamada, un estudiante de secundaria, toma un atajo por el cementerio local y divisa a un joven misterioso que simplemente observa las estrellas. Yoh Asakura le invita a quedarse con él y sus "amigos", pero Manta huye asustado al ver que estos eran fantasmas.
 

1.-Los fantasmas y el misterioso joven
2.-El samurai que espera
3.-El otro shamán
4.-Posesión al cien por ciento
5.-Una linda shamán
6.-El maestro de Kung-Fu
7.-El puño de Lee-Bruce-Long
8.-La vida de un shamán
9.-El joven que vino del norte
10.-Una venganza de 600 años
11.-La lluvia que cae en primavera
12.-El anunciamiento de la estrella
13.-La posesión de objetos
14.-La pelea entre shamanes
15.-Asesinos de ultratumba
16.-El amor de Fausto
17.-El lugar favorito de los dos
18.-Yoh
19.-El alma gigantesca de los dos
20.-El desafío de dos almas
21.-Confianza
22.-Nuestras técnicas especiales
23.-El regreso de un ataoísta
24.-Len-Tao, el inmortal
25.-El viaje de los shamanes
26.-La gigantesca norteamérica
27.-El poder de la radiestesia
28.-La venganza de Lyserg
29.-Megavalor
30.-El oráculo que fue robado
31.-El bosque de los espíritus
32.-La amistad amarga de Horo-Horo
33.-El familiar secreto de los Asakura
34.-Las aguas termales de norteamérica
35.-La leyenda de los vampiros
36.-Un arma celestial
37.-El rey de las bromas
38.-La leyenda de los seminoa
39.-El trío de la flor
40.-La bitácora mágica
41.-Una posesión muy poderosa
42.-El espíritu de la espada
43.-La pelea entre dioses
44.-Un intento más
45.-Los grandes espíritus
46.-El fantasma de la dinastía Tao
47.-Megaamistad
48.-La leyenda del dragón
49.-El doctor Fausto
50.-La obscuridad que hay en mi corazón
51.-La caza de espíritus
52.-Hay que entrenar
53.-Hasta luego
54.-El octavo angel
55.-El portal de Babilonia
56.-La puerta de Babilonia
57.-¿El final del torneo?
58.-Un ángel en llamas
59.-La tierra sagrada
60.-Amigos
61.-Adiós para siempre
62.-Un combate precipitado
63.-El lugar a donde pertenezco
64.-Episodio final - Epílogo